1.R统计绘-RDA分析、Mantel检验及绘
2.asr翱捷什么时候上市?
3.Apache Traffic Server简介
R统计绘-RDA分析、Mantel检验及绘
1 基本信息
ANOSIM、PERMANOVA和MRPP三种群落结构分析方法都是基于分类变量进行的分析,而基于连续变量的群落结构分析使用Mantel检验和variation partition analysis(envfit()函数)。envfit()在 R绘图-RDA排序分析中已经讲过了,DNF套装微调源码这里就只讲Mantel。Mantel分析其实之前也在 R统计-微生物群落结构差异分析及结果解读一文中讲过了,文中还包括偏mantel分析,需要的同学可以去看看。约束性排序分析(RDA或CCA)分析经常都是与mantel检验一起进行,检验环境因子变量与群落结构变化的相关性。之前的推文写的有点复杂、分散,正好最近还需要分析一批数据,文本网源码再写一份RDA + mantel检验的教程。
Mantel()函数用于对两个相异矩阵进行相关性分析,如分别对微生物组成数据和环境因子(C、N、P含量等)计算距离矩阵,然后进行环境因子变化与微生物群落结构间的相关性(或解释度),可以根据数据情况选择使用pearson、spearman或 kendall相关性指数。
2 分析流程
2.1 设置工作路径并调用R包
2.2 数据准备
数据包括1个物种组成丰度表,1个基因丰度表以及1个环境因子表。将环境因子数据分别与物种丰度和基因丰度数据进行RDA和mantel分析。
2.3 RDA分析及绘图
约束性排序其实包括线性模型和单峰模型,具体分类在 R统计-PCA/PCoA/db-RDA/NMDS/CA/CCA/DCA等排序分析教程一文中有详细介绍。RDA属于线性模型,疫情指标源码CCA是单峰模型。因此在进行约束性排序分析之前,需要先对数据进行检测,判断应该选择那种模型。怎样选择模型在 R绘图-RDA排序分析写过,大家可以去看。
注:分析输出结果都详细介绍,在R统计-PCA/PCoA/db-RDA/NMDS/CA/CCA/DCA等排序分析教程一文中有写,这里不再赘述。
2.4 mantel分析及可视化
Science上发表过一幅很漂亮的mantel可视化图,图中还包括环境因子相关性,是使用ggcor画的。但该包作者已经把这个包删除了。不过我在网上搜索发现github上还有人保存的spi源码大全有源码。可以直接安装。但是受我的生物统计老师影响,我的原则是能把原始数据展示出来,就一定要展示出来。所以这里就不重现这幅图了。
绘制气泡图,并添加r值标签,同时显示基因、物种丰度与环境因子的mantel分析结果。
这里只是一个简单的RDA、mantel分析绘图流程,其中时间还有很多需要注意的细节,对环境因子的筛选步骤也省略了。如果想更深入的人脸登录源码了解排序分析,可以看一下数量生态学以及在网上搜索其他资料。
asr翱捷什么时候上市?
大概在6月日的时候,翱捷科技已经在科创板挂牌。说到ASR这个名字,我在这里就不得不提到老板戴老板了,因为他可以说也是一个半导体界的名门望族,美国芯片巨头Marvell和国内芯片设计服务龙头芯片最初由戴氏家族兄弟姐妹创立,戴老板早年创立锐迪科,在美国正式上市,那个时候,2G网络时代,还是非常流行的。而且在那个时候,很多大佬的风头比现在要大得多了,但是,他无奈输给了强行收购的“资本狂人”赵老板,从哪以后,他在私有化后退出了RDA,并带着他公司的所有兄弟创建了一个全新的ASR,据说这个名字是对 SPREADTRUM & RDA 的缩写,取名字的时候不忘展讯和锐迪科,可见他对赵老板的恨意有多深。
但是无论如何,戴老板在圈里的地位还在,随着一声崛起,各路金主纷纷涌向他,不过话虽如此,在场上地位高的人还是比较多的,真正让傲捷赚到钱的,其实是收购了Marvell的移动部门,只用了3.6亿,就获得了多人和一个完整的基带IP,据说他们搬到了这里,Marvell服务器还自带N多源代码,真是白菜价。
按照目前这家芯片公司的估值,这个团队和IP要人均1亿,一个百亿就够了,直接让翱捷有了出货和购买芯片的基础,其次,他在另外2次收购里,不得不说是有点麻烦,不是个人气候的问题,不过,我实在不敢对ASR的上市抱有太高的期望,即使与国内较好的增长预期相比,利润较好的半导体上市公司也会给出倍的市销率,而翱捷则是多亿市值。
Apache Traffic Server简介
Apache Traffic Server,通常简称ATS或TS,是一个功能强大的HTTP代理和缓存服务器。它与Nginx和Squid一样,被设计为提供高效的网络服务。最初由Inktomi公司开发,这家公司后来被Yahoo收购。在年,Yahoo将Traffic Server的源代码捐赠给了Apache软件基金会,并在年,它正式成为ASF的顶级项目,标志着其开源身份的确立。Traffic Server的主要编程语言是C++。
Chuck Neerdaels,Traffic Server的早期开发负责人之一,同时也是Harvest项目的创始人,Harvest项目后来演变成广受欢迎的Squid。Leif Hedstrom接过了Traffic Server的开发领导大旗,尽管Neerdaels和Hedstrom现在分别加入了CDN服务提供商Akamai,但他们对Traffic Server的贡献仍然深远影响着该项目的发展。
作为开源项目,Apache Traffic Server不断吸引着全球开发者们的贡献,为用户提供更快、更可靠的网络服务。它的核心价值在于其模块化设计和高度的性能优化,使其在现代互联网环境中扮演着重要的角色。