1.开源化学信息学库:ScaffoldGraph
开源化学信息学库:ScaffoldGraph
ScaffoldGraph,一个开放源代码的化学信息库,利用RDKit和NetworkX构建,专注于生成和分析骨架网络与支架树。仿微信聊天PHP源码
该库拥有独特优势,与现有软件相比,ssr源码解析它提供了更灵活且精细的骨架网络与支架树构建功能。
ScaffoldGraph目前仅支持Python 3,可以通过conda或pip安装。
使用conda安装,需先配置conda环境,添加通道后,执行命令:conda config --add channels conda-forge conda install -c uclcheminformatics scaffoldgraph。java newcondition源码
或使用pip安装:pip install scaffoldgraph。
以下是ScaffoldGraph的使用示例:生成与分析骨架网络与骨架树。
首先导入库。翻身指标源码
接着载入数据并绘制分子。
利用库函数生成骨架网络。
随后绘制生成的java number源码骨架网络。
分析骨架分布,了解分子骨架的构成。
进行骨架匹配,并高亮显示匹配的骨架。
对分子进行匹配分析,并高亮显示匹配部分。
最后,绘制分子的骨架树,进一步深入分析骨架结构。