1.ASE调用DFT/MD程序使用简介
2.如何部署Qtum量子链节点
3.Quantum Espresso 之pw.x输入文件解读
4.QCDB是量源什么意思?
5.密码学开源库整理
6.源代码经典台词
ASE调用DFT/MD程序使用简介
ASE,一个专为原子尺度模拟和材料性质计算设计的码下Python库,提供了一系列工具,载量适用于构建、代码操作和分析原子结构,量源以及执行多种模拟方法,码下萧啸主图指标源码如分子动力学、载量量子力学、代码分子力学和Monte Carlo等。量源ASE支持多种计算方法,码下包括能量、载量力、代码应力、量源振动频率和电子结构的码下计算,以及从外部文件读取和写入结构。载量它与多种第三方计算软件如VASP、Quantum ESPRESSO、LAMMPS等集成,可轻松融入模拟工作流程。
ASE的安装简易,只需确保Python运行环境正确,通过pip install ase命令安装。对于离线状态,从官网下载源码包,有源码和没有源码的区别解压后用python3 setup.py install –user安装。建议安装最新版本的ASE配合最新Python运行环境(Python版本大于3.5)以确保兼容性。使用Ubuntu 以后版本的Linux系统,自带较高版本的Python及库文件,可简化安装流程。
ASE调用计算程序如VASP、QE、DMOL3、LAMMPS等主要通过添加特定的计算器选择类中的环境变量。以下示例展示了调用不同程序的基本步骤:
1. **调用VASP**:
通过配置环境变量,编写代码直接运行,减少设置INCAR、KPOINTS、POTCAR等文件的步骤。利用Python的灵活性进行循环计算和数据处理。
2. **调用QE**:
类似于调用VASP,仅需调整环境变量名称即可。
3. **调用DMOL3**:
需要通过LAMMPS自带的Python接口加载LAMMPS程序作为Python库,然后通过ASE接口命令调用。
4. **调用LAMMPS**:
通过LAMMPS自带的Python接口,直接调用分子动力学软件。
示例代码如官网提供的使用ASE调用VASP计算NaCl总磁矩的例子(test.py),只需配置好环境变量,3d旋转立体相册源码源码编写代码并运行python test.py > test.out即可完成任务。
查阅更多关于ASE调用计算程序的详细信息和操作指南,请访问ASE的计算器使用说明网站:wiki.fysik.dtu.dk/ase/a...
祝大家科研工作顺利,探索原子模拟领域的无限可能!
如何部署Qtum量子链节点
获取Qtum节点可以通过以下四种方法之一获得Qtum节点程序:
1. 直接下载二进制文件
如果你并不关心Qtum的源码,部署Qtum节点最方便的方法是在Qtum release page(点击打开)下载最新的二进制文件,目前支持的平台包括Linux,Windows,OSX。建议选择最新版进行下载,本教程以撰写时的最新版v0..为例。
(注意,你所看到最新版的版本号可能不同,如这里是0..,其他字符串保持不变)
Mac用户请下载:qtum-0..-osx.tar.gz
Linux用户请下载: qtum-0..-i-pc-linux-gnu.tar.gz(位)或qtum-0..-x_-linux-gnu.tar.gz(位)
Windows用户请下载:qtum-0..-win.zip(位)或qtum-0..-win.zip(位)
树莓派用户请下载:qtum-0..-arm-linux-gnueabihf.tar.gz
下载压缩包解压后,<解压路径>/bin/下包含qtumd和qtum-cli,即为本教程要用到的Qtum节点可执行文件。
Quantum Espresso 之pw.x输入文件解读
Quantum Espresso(QE)是一款基于密度泛函理论、采用平面波方法及赝势理论的第一性原理计算软件。其开源特性与全面的超软赝势库使其在量子化学计算领域优势显著,尤其适合对VASP版权有顾虑的研究人员。本文将聚焦于QE的DFT计算模块pw.x的输入文件解析。
pw.x的输入文件结构清晰,由一系列“&”和“/”符号分割的im源码im即时通讯源码控制计算部分组成。各选项间默认有默认值,具体规则在源码包路径下的文档中详细列出。文件中包括了所有模块及命令的列表,点击即可跳转至对应的解释、默认值及设置方法。
值得注意的是,要成功运行pw.x,还需要下载对应的赝势文件。这些文件可在Quantum Espresso的官方网站上找到,下载网址为:pseudopotentials.quantum-espresso.org...
对于QE的安装、运行及后处理过程,可参考以下链接了解更多:
最新版Quantum Espresso的安装与使用
物理VS化学吸附?RDG,让你的文章与众不同
祝您科研顺利,探索量子化学的奥秘!
公众号推荐:计算运维鸟
QCDB是什么意思?
QCDB是量子化学设计与开发库的缩写,其全称为Quantum Chemistry Design and Development Library。QCDB是一个强大的工具,可以用于分子结构的建模和计算,从而提供了对分子的详细信息,如分子的能量、构型、振动、电荷分布等。燕窝朔源码与非朔源码区别
QCDB是一个开放源代码的软件库,允许用户访问并修改其源代码。该库支持许多流行的量子化学软件,包括Gaussian、Molpro和Psi4。QCDB还提供了各种量化方法,包括密度泛函理论、耦合簇理论和多体微扰论等,并且还支持矩阵元和能量导数的计算。
QCDB是目前量子化学领域中最流行和最广泛使用的工具之一。通过使用QCDB,研究人员可以准确地描述分子的性质,从而推进化学和材料科学等领域的发展。QCDB的发展使得量子化学的计算能力越来越强大,为理解和发现新的化合物和反应提供了更加详细和准确的信息。
密码学开源库整理
密码学开源库整理 维护一个密码学开源列表,旨在促进大家的共同学习与交流。持续更新中,欢迎投稿,贡献宝贵的资源。基础密码库
C/C++ MIRACL Crypto SDK- 一个广泛认可的多精度整数和有理数加密库,被视作椭圆曲线密码学的黄金标准。 OpenSSL- 用于传输层安全协议的健壮、商业级、功能齐全的开源工具包。 Tongsuo (原BabaSSL)- 提供现代密码学算法和安全通信协议的开源基础库,适用于各种业务场景。 NTL- 高性能、可移植的C++库,提供整数、向量、矩阵、多项式和浮点运算的数据结构和算法。 cryptoPP- 一个开源C++密码学库,包含了众多密码算法。 PBC- 一个基于GMP库的免费C库,用于执行基于配对的密码系统的数学运算。 NaCl- 一个易于使用的高效密码库,专为网络通信、加密、解密、签名等设计。 Sodium- NaCl的一个分支,具有兼容和扩展API,提供构建更高级加密工具所需的核心操作。 RELIC- 一个面向研究的现代密码原语工具箱,强调效率和灵活性。 OpenABE- 集成了各种基于属性的加密算法、行业标准加密功能和工具,易于使用。 cpabe toolkit- 实现基于密文策略的属性加密方案的程序,使用PBC库进行代数运算。 Paillier- 公钥密码系统,提供加法同态性,适用于保护隐私的应用。 代理重新加密- 公钥加密的一种形式,允许用户将其解密权委托给另一个用户。 BGW广播加密- 允许广播者向一组接收者发送加密信息的方案。JAVA
The Java Pairing-Based Cryptography Library (JPBC)- 一个开源密码工具箱,支持国密算法、数字证书和SSL/TLS安全通信协议。Python
pyUmbral- Umbral阈值代理重新加密方案的参考实现,支持密文委托。Golang
The Go Pairing-Based Cryptography Library- 提供不同SOTA函数式加密方案的实现。 CONIKS- 一个密钥管理系统,提供终端用户加密密钥的透明度和隐私保护。隐私增强技术库
mpc和FHE库- 包括ecc、paillier、elgamal等基础公钥密码算法。区块链与零知识证明
Rust/C++库- 实现zkSNARK方案的零知识证明系统。量子安全密码
liboqs- 一个开放源码C库,包含量子安全加密算法的开源实现。可搜索加密
收集的可搜索加密列表。隐私保护机器学习
收集的Secure Deep Learning代码库列表。 贡献者:源代码经典台词
1、Rutledge:The brain is like that,its electromagnetic field remains charged,just briefly even after death.Circuits remain open.Now there is another peculiarity about the brain.It contains a short-term memory track that's approximately 8 minutes long like a convenience store's security camera that only records the last portion of the day's activity on its hard drive.Now combining these two phenomena,circuitry that remains viable postmortem and a memory bank that goes back 8 minutes.Source Code enable是 us to capitalize on the overlap.
拉特里奇:我们的大脑也一样,人死后大脑的电磁场仍然处于通电状态,电路依然通畅,大脑还有一个特性,它存有一个短期记忆轨迹,时长约8分钟,就像便利店的安全摄像机一样能在硬盘上记录每一天的最后部分,把这两种现象结合起来,人死后脑电图保持接通,人死后脑电图保持接通,记忆库前调8分钟,源代码就能帮助我们利用那重叠部分。
2、Rutledge:Source Code is not time travel.Rather,Source Code is time reassignment.
拉特里奇:源代码不是时间穿梭,而逝对时间的再赋值。
3、Colter Stevens:Don't sweat the small stuff,you'll drown.
考尔特·史蒂文斯:别为那些琐事汗流浃背,小心汗水逆流成河。
4、Colter Stevens:Christina,what would you do if you knew you had less than a minute to live?
考尔特·史蒂文斯:克里斯汀娜,如果你只有一分钟不到的生命,你会怎么做?
Christina:I'd make those seconds count.
克里斯汀娜:我会让每秒钟都变得有意义。
5、Colter Stevens:I'd kiss you again.
考尔特·史蒂文斯:我会再吻你一次。
Christina:Again?
克里斯汀娜:你吻过吗?
6、Colter Stevens:Do you believe in fate?
考尔特·史蒂文斯:你相信命运吗?
Christina:Not really.I'm more of a dumb luck kind of gal.
克里斯汀娜:不太信,只能撞些狗屎运。
7、The explosion came from behind me.
爆炸来自于我后方。
8、I need you to discipline yourself on this next pass.
我需要你在下一个任务中管好自己
Perform only the task that we assign you.
Everything else is irrelevant.
做好我们交给你的任务就行,其他别管
9、Captain, it's gonna be counterproductive for you to try to save anyone on that train.
上尉,试图挽救车上任何乘客会产生不良后果
、Well, but she survived.And maybe the rest could too.
但她幸免于难,也许其他人也可以
、She survived, but only inside the Source Code.None of them will be safe.
她幸免于难,相对在源代码世界,现实仍是死亡
、What is this Source Code?It's quantum mechanics parable calculus.It's very complicated.
源代码是什么?量子力学所演化,相当复杂。
、The brain is like that, its electromagnetic fieldremains charged, just briefly even after death.Circuits remain open.
大脑也同样,即便人死后脑电磁场的能量也会短暂残留。脑回路依然开放着
、Now there is another peculiarity about the brain.It contains a short-term memorytrack that's approximately 8 minutes long
大脑还有另一特征,能保持段约8分钟的短期记忆轨道。
、like a convenience store's security camera that only records the last portion of the day's activity on its hard drive.
像便利店里的监视器,只能在硬盘上记录当日影像的最后一部分。
、Source Code enables us to capitalize on the overlap.
源代码世界允许我们同时利用二者。
、You cannot exist inside the Source Code,beyond Fentress' 8 minutes.
源代码世界中你只能存在那8分钟里。
、Source Code is not time travel.
源代码不是时空旅行
、Rather, Source Code is time reassignment.
实际上源代码只是时空重现
、What would you do if you only had one minute left to live?I don't know
假如生命剩下一分钟你会做什么,我不知道。
、You cannot alter the continuum of this reality from within the Source Code.
你在源代码世界里无法影响到这个世界。