1.ASE调用DFT/MD程序使用简介
2.Quantum Espresso 之pw.x输入文件解读
3.什么是源码. asm文件?
4.盘点8个地图开发的开源项目,yyds!源码
ASE调用DFT/MD程序使用简介
ASE,源码一个专为原子尺度模拟和材料性质计算设计的源码Python库,提供了一系列工具,源码适用于构建、源码文字网站源码操作和分析原子结构,源码以及执行多种模拟方法,源码如分子动力学、源码量子力学、源码分子力学和Monte Carlo等。源码ASE支持多种计算方法,源码包括能量、源码力、源码应力、源码振动频率和电子结构的计算,以及从外部文件读取和写入结构。它与多种第三方计算软件如VASP、烽火ol 源码 搭建Quantum ESPRESSO、LAMMPS等集成,可轻松融入模拟工作流程。
ASE的安装简易,只需确保Python运行环境正确,通过pip install ase命令安装。对于离线状态,从官网下载源码包,解压后用python3 setup.py install –user安装。建议安装最新版本的ASE配合最新Python运行环境(Python版本大于3.5)以确保兼容性。使用Ubuntu 以后版本的Linux系统,自带较高版本的Python及库文件,可简化安装流程。
ASE调用计算程序如VASP、QE、DMOL3、LAMMPS等主要通过添加特定的天空网站源码计算器选择类中的环境变量。以下示例展示了调用不同程序的基本步骤:
1. **调用VASP**:
通过配置环境变量,编写代码直接运行,减少设置INCAR、KPOINTS、POTCAR等文件的步骤。利用Python的灵活性进行循环计算和数据处理。
2. **调用QE**:
类似于调用VASP,仅需调整环境变量名称即可。
3. **调用DMOL3**:
需要通过LAMMPS自带的Python接口加载LAMMPS程序作为Python库,然后通过ASE接口命令调用。
4. **调用LAMMPS**:
通过LAMMPS自带的Python接口,直接调用分子动力学软件。
示例代码如官网提供的使用ASE调用VASP计算NaCl总磁矩的例子(test.py),只需配置好环境变量,编写代码并运行python test.py > test.out即可完成任务。
查阅更多关于ASE调用计算程序的详细信息和操作指南,请访问ASE的书奇小说源码计算器使用说明网站:wiki.fysik.dtu.dk/ase/a...
祝大家科研工作顺利,探索原子模拟领域的无限可能!
Quantum Espresso 之pw.x输入文件解读
Quantum Espresso(QE)是一款基于密度泛函理论、采用平面波方法及赝势理论的第一性原理计算软件。其开源特性与全面的超软赝势库使其在量子化学计算领域优势显著,尤其适合对VASP版权有顾虑的研究人员。本文将聚焦于QE的DFT计算模块pw.x的输入文件解析。
pw.x的输入文件结构清晰,由一系列“&”和“/”符号分割的控制计算部分组成。各选项间默认有默认值,具体规则在源码包路径下的文档中详细列出。文件中包括了所有模块及命令的列表,点击即可跳转至对应的解释、默认值及设置方法。
值得注意的是,要成功运行pw.x,还需要下载对应的赝势文件。这些文件可在Quantum Espresso的捕鱼游戏源码c官方网站上找到,下载网址为:pseudopotentials.quantum-espresso.org...
对于QE的安装、运行及后处理过程,可参考以下链接了解更多:
最新版Quantum Espresso的安装与使用
物理VS化学吸附?RDG,让你的文章与众不同
祝您科研顺利,探索量子化学的奥秘!
公众号推荐:计算运维鸟
什么是. asm文件?
.asm文件是以asm作为扩展名的文件,是汇编语言的源程序文件。它是文本格式的文件,可以用任何文本编辑器(如:windows下的notepad、notepad+、editplus、ultraedit,dos下的edit.com、qe.exe等)进行创建或编辑。
这种类型的文件必须满足微软或borland或其他开源组织对汇编语言源代码的语法规则的要求。如果你写的.asm文件不满足语法规则、或者存在算法或者业务逻辑上的错误,前者将无法通过编译程序的编译,后者即使生成了可执行程序也不能得到你需要的结果。
与上节对应,.asm文件的编译器有微软的masm(masm)、borland公司的tasm、开源组织的nasm等,通过这些编译器编译后将生成扩展名为obj的目标文件。再通过对应的链接程序(如link、tlink等)将obj文件转化为可执行的exe文件。
盘点8个地图开发的开源项目,yyds!
地图开发领域中,开源项目提供了丰富的资源和工具,以下是一些具有代表性的项目,它们在不同方面展现出其独特价值。 Historical-Atlas 这个项目以其直接的命名“历史地图集”吸引了众多关注,作者采用的AGPL-3.0开源协议使得它不仅适合作为参考设计思路或在线服务提供,也鼓励其作为软件产品对外分发时保持开源状态。项目中存在一些遗留问题,如数据库配置和用户信息存储的实现,但通过对照源码,还原表结构并不困难。 vue3-ts-cesium-map-show 由地虎降天龙开发的这个项目,采用MIT开源许可协议,是一个专注于三维可视化数字城市应用,结合Cesium-1.开源库,提供后台可视化编辑与保存功能。 QGIS 作为开源地理信息系统,QGIS支持Windows、Linux、MacOS,拥有强大的地理空间管理与分析能力,包括时间动画、3D地图预览和地图美化等特性,使用户能够生成美观的地图。 react-baidu-map 由uiw开发的react-baidu-map项目,基于React封装了百度地图组件,简化了将地图集成到React项目的过程,使开发者能够快速接入地图功能。 Maptalks Maptalks是一个HTML5地图引擎,基于原生ES6 Javascript开发,提供二三维一体化地图能力,通过二维地图旋转、倾斜增加三维视角,并支持插件化设计。 QuickEarth-Free QuickEarth(QE)是一个面向个人免费开放的二三维一体化Web端矢量和栅格数据渲染引擎,适用于气象、海洋、水文、环境等领域,帮助用户实现数据可视化。 地图下载器 使用Java开发的地图瓦片图下载工具,支持多种地图服务,如OpenStreetMap、天地图、谷歌地图等,提供XYZ瓦片图下载与合并功能,方便用户获取地图数据。 L7 L7是蚂蚁金服AntV推出的一款基于WebGL的开源大规模地理空间数据可视分析框架,专注于数据可视化表达,通过多种视觉变量设置实现信息的有效呈现,满足地图图表、BI系统可视化分析、GIS等领域的需求。 xdh-map xdh-map是一款基于Openlayers的地图应用Vue组件,内置多种地图瓦片,并支持与多个PGIS厂商对接,提供丰富的组件,如文本、图形、热力图等,以及与ECharts结合实现基于地理位置的图表,满足项目常见需求。 这些开源项目在地图开发领域中各具特色,为开发者提供了丰富的选择和强大的技术支持。