1.Seurat 4 源码解析 8: step4 QC可视化 VlnPlot()
2.电脑页面的码分什么特效？
3.Apache Ranger整合Hadoop、Hive、码分Spark实现权限管理
4.HUE从安装到塌方
Seurat 4 源码解析 8: step4 QC可视化 VlnPlot()
本文旨在深入解析Seurat 4.1.0版本中用于质量控制和可视化的码分VlnPlot()函数，为不同层次的码分用户提供全面理解。VlnPlot()函数是码分Seurat分析流程中的关键组成部分，帮助用户以可视化形式评估数据质量，码分权证源码怎么写从而为后续分析提供可靠依据。码分下面，码分我们将逐步解析该函数的码分实现原理及用途。
VlnPlot()函数的码分实现基于R语言，位于seurat-4.1.0/R/visualization.R:文件中。码分其核心逻辑简洁而高效，码分通过一个if语句判断新版本的码分split.by功能是否发生变化，根据实际情况返回ExIPlot()函数。码分这个函数不仅揭示了Seurat包在设计时注重用户友好性和错误提示的码分特性，也展现了其内部结构的复杂性。
ExIPlot()函数则在文件中占据更多空间，定义在seurat-4.1.0/R/visualization.R:。它主要调用了SingleExIPlot()函数，通过这个函数进一步细化表达与身份的可视化。SingleExIPlot()函数在代码的最后十几行中首次调用ggplot2库，展示数据可视化的过程。
在解析过程中，我们还探讨了与VlnPlot()函数相关的其他函数，如DefaultAssay<-()、AutoPointSize()、InvertHex()、interaction()等，带符号源码它们在数据处理、颜色生成、颜色反转、交互作用计算等不同环节发挥着关键作用。其中，AutoPointSize()函数用于自动调整散点图中点的大小，InvertHex()则提供了一种将颜色从进制转换为互补色的方法，进一步丰富了数据可视化的表现形式。
本文还提到了一些R语言技巧，如如何控制函数参数改变时的提示显示次数、合理设置图形列数、自动获取差异尽可能大的颜色以及如何使用Scales库中的hue_pal()函数等。这些技巧对于提升R语言编程效率和数据可视化质量具有重要意义。
总结而言，VlnPlot()函数是Seurat包中用于质量控制和可视化的强大工具，通过其内部实现逻辑和与之相关的辅助函数，为用户提供了一种高效、直观的方法来评估和理解单细胞转录组数据的质量。通过深入解析这些函数的实现细节，用户不仅可以更好地利用Seurat包进行数据分析，还能进一步提升数据可视化能力，为科学研究提供有力支持。
电脑页面的什么特效？
这个是html5的效果，以下是源代码：
<!DOCTYPE html>
<html xmlns="/texiao/html5/index/hovertreewelcome.css" type="text/css" rel="stylesheet" />
</head>
<body ondragstart="window.event.returnValue=false" oncontextmenu="window.event.returnValue=false" onselectstart="event.returnValue=false">
<div id="hovertreecontainer">
<div>
<h1 id="h1">何问起 </h1>
<h2 id="h2"> 想问候，不知从何问起，就直接说喜欢你！</h2>
<h3 id="h2">hovertree.com为您提供前端特效,梦幻昆仑源码案件ASP.NET等设计开发资料。<a href="/hvtart/bjae/onxw4ahp.htm">原文</a> <a href="/texiao/">特效</a></h3>
<p> </p>
<p><strong><a href="/">进入主站</a></strong></p>
<p> </p>
<p> </p>
<p> </p>
<p> </p>
<p> </p>
</div>
</div>
<canvas id="canvas"></canvas>
<audio autoplay="autoplay">
<source src="" type="audio/ogg">
<source src="/hovertreesound/hovertreexihuanni.mp3" type="audio/mpeg">
您的浏览器不支持播放音乐。请用支持html5的浏览器打开,例如chrome或火狐或者新版IE等。
<br />何问起 hovertree.com
</audio><script type="text/javascript" src="/texiao/html5/index/hovertreewelcome.js">
</script>
<script type="text/javascript">
; (function (window) {
var ctx,
hue,
logo,
form,
buffer,
target = { },
tendrils = [],
settings = { };
settings.debug = true;
settings.friction = 0.5;
settings.trails = ;
settings.size = ;
settings.dampening = 0.;
settings.tension = 0.;
Math.TWO_PI = Math.PI * 2;
// ========================================================================================
// Oscillator 何问起
// ----------------------------------------------------------------------------------------
function Oscillator(options) {
this.init(options || { });
}
Oscillator.prototype = (function () {
var value = 0;
return {
init: function (options) {
this.phase = options.phase || 0;
this.offset = options.offset || 0;
this.frequency = options.frequency || 0.;
this.amplitude = options.amplitude || 1;
},
update: function () {
this.phase += this.frequency;
value = this.offset + Math.sin(this.phase) * this.amplitude;
return value;
},
value: function () {
return value;
}
};
})();
// ========================================================================================
// Tendril hovertree.com
// ----------------------------------------------------------------------------------------
function Tendril(options) {
this.init(options || { });
}
Tendril.prototype = (function () {
function Node() {
this.x = 0;
this.y = 0;
this.vy = 0;
this.vx = 0;
}
return {
init: function (options) {
this.spring = options.spring + (Math.random() * 0.1) - 0.;
this.friction = settings.friction + (Math.random() * 0.) - 0.;
this.nodes = [];
for (var i = 0, node; i < settings.size; i++) {
node = new Node();
node.x = target.x;
node.y = target.y;
this.nodes.push(node);
}
},
update: function () {
var spring = this.spring,
node = this.nodes[0];
node.vx += (target.x - node.x) * spring;
node.vy += (target.y - node.y) * spring;
for (var prev, i = 0, n = this.nodes.length; i < n; i++) {
node = this.nodes[i];
if (i > 0) {
prev = this.nodes[i - 1];
node.vx += (prev.x - node.x) * spring;
node.vy += (prev.y - node.y) * spring;
node.vx += prev.vx * settings.dampening;
node.vy += prev.vy * settings.dampening;
}
node.vx *= this.friction;
node.vy *= this.friction;
node.x += node.vx;
node.y += node.vy;
spring *= settings.tension;
}
},
draw: function () {
var x = this.nodes[0].x,
y = this.nodes[0].y,
a, b;
ctx.beginPath();
ctx.moveTo(x, y);
for (var i = 1, n = this.nodes.length - 2; i < n; i++) {
a = this.nodes[i];
b = this.nodes[i + 1];
x = (a.x + b.x) * 0.5;
y = (a.y + b.y) * 0.5;
ctx.quadraticCurveTo(a.x, a.y, x, y);
}
a = this.nodes[i];
b = this.nodes[i + 1];
ctx.quadraticCurveTo(a.x, a.y, b.x, b.y);
ctx.stroke();
ctx.closePath();
}
};
})();
// ----------------------------------------------------------------------------------------
function init(event) {
document.removeEventListener('mousemove', init);
document.removeEventListener('touchstart', init);
document.addEventListener('mousemove', mousemove);
document.addEventListener('touchmove', mousemove);
document.addEventListener('touchstart', touchstart);
mousemove(event);
reset();
loop();
}
function reset() {
tendrils = [];
for (var i = 0; i < settings.trails; i++) {
tendrils.push(new Tendril({
spring: 0. + 0. * (i / settings.trails)
}));
}
}
function loop() {
if (!ctx.running) return;
ctx.globalCompositeOperation = 'source-over';
ctx.fillStyle = 'rgba(8,5,,0.4)';
ctx.fillRect(0, 0, ctx.canvas.width, ctx.canvas.height);
ctx.globalCompositeOperation = 'lighter';
ctx.strokeStyle = 'hsla(' + Math.round(hue.update()) + ',%,%,0.)';
ctx.lineWidth = 1;
if (ctx.frame % == 0) {
console.log(hue.update(), Math.round(hue.update()), hue.phase, hue.offset, hue.frequency, hue.amplitude);
}
for (var i = 0, tendril; i < settings.trails; i++) {
tendril = tendrils[i];
tendril.update();
tendril.draw();
}
ctx.frame++;
ctx.stats.update();
requestAnimFrame(loop);
}
function resize() {
ctx.canvas.width = window.innerWidth;
ctx.canvas.height = window.innerHeight;
}
function start() {
if (!ctx.running) {
ctx.running = true;
loop();
}
}
function stop() {
ctx.running = false;
}
function mousemove(event) {
if (event.touches) {
target.x = event.touches[0].pageX;
target.y = event.touches[0].pageY;
} else {
target.x = event.clientX
target.y = event.clientY;
}
event.preventDefault();
}
function touchstart(event) {
if (event.touches.length == 1) {
target.x = event.touches[0].pageX;
target.y = event.touches[0].pageY;
}
}
function keyup(event) {
switch (event.keyCode) {
case :
save();
break;
default:
// console.log(event.keyCode); hovertree.com
}
}
function letters(id) {
var el = document.getElementById(id),
letters = el.innerHTML.replace('&', '&').split(''),
heading = '';
for (var i = 0, n = letters.length, letter; i < n; i++) {
letter = letters[i].replace('&', '&');
heading += letter.trim() ? '<span class="letter-' + i + '">' + letter + '</span>' : ' ';
}
el.innerHTML = heading;
setTimeout(function () {
el.className = 'transition-in';
}, (Math.random() * ) + );
}
function save() {
if (!buffer) {
buffer = document.createElement('canvas');
buffer.width = screen.availWidth;
buffer.height = screen.availHeight;
buffer.ctx = buffer.getContext('2d');
form = document.createElement('form');
form.method = 'post';
form.input = document.createElement('input');
form.input.type = 'hidden';
form.input.name = 'data';
form.appendChild(form.input);
document.body.appendChild(form);
}
buffer.ctx.fillStyle = 'rgba(8,5,)';
buffer.ctx.fillRect(0, 0, buffer.width, buffer.height);
buffer.ctx.drawImage(canvas,
Math.round(buffer.width / 2 - canvas.width / 2),
Math.round(buffer.height / 2 - canvas.height / 2)
);
buffer.ctx.drawImage(logo,
Math.round(buffer.width / 2 - logo.width / 4),
Math.round(buffer.height / 2 - logo.height / 4),
logo.width / 2,
logo.height / 2
);
window.open(buffer.toDataURL(), 'wallpaper', 'top=0,left=0,width=' + buffer.width + ',height=' + buffer.height);
// form.input.value = buffer.toDataURL().substr();
// form.submit(); hovertree.com
}
window.requestAnimFrame = (function () {
return window.requestAnimationFrame || window.webkitRequestAnimationFrame || window.mozRequestAnimationFrame || function (fn) { window.setTimeout(fn, / ) };
})();
window.onload = function () {
ctx = document.getElementById('canvas').getContext('2d');
ctx.stats = new Stats();
ctx.running = true;
ctx.frame = 1;
logo = new Image();
logo.src = 'ht' + 'tp://ho' + 'vertree.c' + 'om/themes/hvtimages/hvtlogo.p' + 'ng';
hue = new Oscillator({
phase: Math.random() * Math.TWO_PI,
amplitude: ,
frequency: 0.,
offset:
});
letters('h1');
letters('h2');
document.addEventListener('mousemove', init);
document.addEventListener('touchstart', init);
document.body.addEventListener('orientationchange', resize);
window.addEventListener('resize', resize);
window.addEventListener('keyup', keyup);
window.addEventListener('focus', start);
window.addEventListener('blur', stop);
resize();
if (window.DEBUG) {
var gui = new dat.GUI();
// gui.add(settings, 'debug');
settings.gui.add(settings, 'trails', 1, ).onChange(reset);
settings.gui.add(settings, 'size', , ).onFinishChange(reset);
settings.gui.add(settings, 'friction', 0., 0.).onFinishChange(reset);
settings.gui.add(settings, 'dampening', 0., 0.4).onFinishChange(reset);
settings.gui.add(settings, 'tension', 0., 0.).onFinishChange(reset);
document.body.appendChild(ctx.stats.domElement);
}
};
})(window);
</script>
</body>
</html>
Apache Ranger整合Hadoop、Hive、Spark实现权限管理
在先前的文章《说说PB级生产上重要的Spark 3.x性能优化方向》中，提到了业务人员在处理数据时可能因误操作而造成数据损坏的问题。在许多场景中，数仓需要直接开放给业务分析人员使用，他们经常执行SQL进行场景分析和验证。为此，可以提供一个WebUI供他们使用，如Hue。然而，由于数仓数据庞大，不可能全部开放给业务人员，因此对外供数时必须提供权限控制。
权限控制方面，CDH上提供的Sentry是一个不错的选择，它基于RBAC进行授权，可以针对库、表等设置不同用户权限。CM的加入使得Sentry的配置变得简单，但Sentry在用户管理方面较为繁琐，且项目已进入Apache Attic，因此选择Sentry并非明智之举。
实际上，许多公司的源码 抄袭 国外 案件生产环境都是外网隔离的，特别是涉及敏感数据的小猴公司。开发、运维人员进入生产环境需要经过严格的校验，接入公司的生产专用网络，并通过堡垒机，任何人都无法导出数据，且每个操作都有审计跟踪。尽管如此，业务人员仍需开放访问，尽管他们通过专门的跳板机访问，但依然存在风险。
Apache Ranger只要有大数据集群的地方就都需要。本文解决了Ranger不支持Spark SQL的问题，实现了库、表、行、列级别的细粒度权限控制。由于官方文档和百度文档有限，本文将分享相关信息，希望能帮助到大家。
Apache Ranger是一个用于Hadoop平台上的权限框架，旨在服务于整个大数据生态圈。随着Hadoop在数据湖领域方案的成熟，对数据权限控制的要求也日益提高。Ranger现在提供了更多对大数据生态组件的支持。
Hadoop中的数据访问多样化，如存储在HDFS的idea运行显示源码数据可以被Hive、Spark或Presto访问。这么多组件访问数据，若不进行集中权限控制，数据安全性将面临严重问题。因此，大数据平台通常需要一个集中管理权限的组件或框架，Ranger正是这样的组件。
当前Ranger版本为2.1，官方提供的版本为2.1。编译测试基于Ranger 2.1版本。官方未提供安装包，需要手动下载Ranger源码包进行编译。编译环境要求提前安装，具体可参考官方网站。
编译成功后，将tar.gz包拷贝到本地。部署Ranger Admin的安装方式与Ranger类似：安装Ranger admin、创建ranger用户并设置密码、上传解压安装包、拷贝MySQL JDBC库、在MySQL中创建ranger库和用户、初始化配置、初始化Ranger admin。若显示成功，则表示初始化成功。在MySQL中可以看到ranger数据库中已创建大量表。
配置Ranger设置数据库密码、配置环境变量、启动Ranger admin访问web UI。登录后，主界面显示如下。点击右上角的“Swith to latest UI”可以切换到最新的UI展示。若安装过程中出现问题，请检查日志。
安装Ranger usersync配置admin认证模式。Ranger中admin的认证方式有三种：Unix、Active Directory、Kerberos。此处使用Unix方式进行认证，意味着后续Ranger admin登录会按照Linux中的认证同步。上传解压Ranger usersync组件、修改初始化配置、初始化配置、配置Linux系统用户组同步配置环境变量、启动usersync服务、修改Ranger admin的认证方式、重新启动Ranger admin。在ranger-admin中可以看到所有Linux中的所有用户。
安装Ranger HDFS插件。注意，HDFS插件需要安装在NameNode对应的节点中，YARN插件需要安装在ResourceManager对应的节点上。解压HDFS插件、初始化配置、启用hdfs插件。Ranger HDFS插件会将当前的配置文件保存备份。可以查看ranger对这些配置文件的更改。
在PM中添加HDFS服务、配置HDFS服务权限策略、默认策略、策略配置、测试用户访问权限、在ranger中添加组合用户、基于角色授权、测试。我们发现，只要Ranger中的权限已更新，hdfs客户端就可以实现更新。
按照之前的配置，审计日志信息保存在指定目录。找到一条审计日志，查看其中的内容。审计日志中包含操作时间、路径、资源类型、对应Ranger中的策略等信息。一旦出现安全类问题，通过审计日志可以检查到进行了哪些操作。
部署Ranger HDFS HA。在HDFS的HA集群上，NameNode可能会发生failover，因此非常有必要在每个HDFS的NameNode上部署一个HDFS插件，以确保在HA切换时能够正常控制权限。部署hdfs plugin到每个NameNode节点、初始化NameNode、测试NameNode节点权限。测试lisi用户在/tmp目录的写入权限，发现当前lisi没有写入权限。在Ranger中启用sales角色的用户具备/tmp目录可写权限。重新执行写入操作，NameNode接入Ranger权限控制成功。
部署Ranger框架整合Hive、上传解压Hive插件、初始化配置、启动Hive插件。Ranger会对Hive的配置文件进行处理，生成hiveserver2-site.xml、ranger-hive-audit.xml、ranger-hive-security.xml等文件。重新启动Hive、beeline登录到hive、在PM中添加Hive服务、添加Hive Service、查看权限策略、查看默认hive导入的权限、使用hive查看数据、给hadoop组用户授权、检查spark用户操作权限、授权hadoop组、对某个库、表、列设置细粒度权限、测试数据打码处理、测试Ranger Admin crash对Hive的影响、部署Ranger Spark SQL、编译Apache submarine spark-security模块、配置、配置Spark SQL、测试Thrift Server、测试Spark SQL SHELL、到此Ranger整合Spark SQL完成、查看spark sql审计日志、报错信息处理、找不到AllocationFileLoaderService$Listener、异常信息、解决办法、参考文献。
HUE从安装到塌方
Hue：集成界面的友好选择 作为一个功能强大的界面集成框架，Hue旨在将我们学习和即将接触的各种框架整合在一个简洁的界面中，使得数据处理和监控变得易如反掌。它拥有类似的竞争产品如Apache Zeppelin。 安装Hue的过程相对复杂，官方并未提供预编译的安装包。为了确保顺利安装，建议在没有安装过MySQL的节点上操作，以避免版本冲突。以下是在Linux系统上安装Hue的详细步骤：首先，你需要下载两个软件包：hue-release-4.3.0.zip和apache-maven-3.6.3bin.tar.gz，然后将它们上传并解压。
接下来，确保安装必要的依赖包，这对于构建Hue环境至关重要。
安装Maven，这是Hue构建和管理项目所依赖的构建工具。
然后，开始Hue的编译过程，将源代码转换为可执行的程序。
配置Hadoop，确保Hue能与Hadoop生态系统无缝协作。
最后，对Hue进行个性化配置，并启动服务，完成集成环境的搭建。
一旦Hue成功整合了HDFS、YARN、Hive以及MySQL，你可以重启Hue服务，开始享受集成后的高效数据分析体验。
