1.生信爱好者周刊(第 47 期):RStudio 改名 Posit
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生信爱好者周刊(第 47 期):RStudio 改名 Posit
祝各位读者国庆假期快乐,我们下期将延期一周准备和发布。
本周话题:RStudio 改名 Posit
RStudio 宣布改名为 Posit,以拓展其在数据科学领域的应用范围,其核心产品 RStudio 编辑器保持不变。RStudio 从改名中可以推测其在数据科学领域的大鹅源码雄心壮志,其产品如 Quarto 承载着将 RMarkdown 的成功推广到多种编程语言的愿景。我们期待 Posit 公司在未来为 R 社区带来更多的进步,包括软件生态、编程范式、计算性能。
生信研究
1、Science | 人类细胞图谱
人类细胞图谱合作组发表了四篇人类多组织单细胞图谱的password表单源码研究,由 Science 杂志封面展示。北京大学张泽民教授对此进行了评述,并发表了一篇观点文章:Mapping cell types across human tissues。这些论文提供了迄今为止最全面、最多组织的细胞图谱,涵盖了人类个器官的超过一百万个单细胞数据。
2、iScience | 首个细胞级组装的人体集成细胞图谱hECA
张学工研究团队开发了一个统一的信息学框架,用于细胞中心数据无缝组装,并从分散的数据中构建了首个细胞级组装的人体集成细胞图谱(hECA)。hECA 包含了来自个已发表数据集的1,,个已标记的人类细胞,涵盖了个器官和个系统。upstart 源码 ubuntu新概念“细胞级组装”指的是对不同来源的人体单细胞数据经过统一质控和预处理后,按照统一信息框架集成到同一个数据集合体中,保存了每个细胞的所有信息。
3、Nature Genetics | 多维空间组学研究揭示:肿瘤微环境结构可作为乳腺癌临床预后的有效指征
剑桥大学的研究团队使用成像质谱流式技术(Imaging Mass Cytometry, IMC)结合基因组、临床数据进行了多维空间分析,揭示了乳腺肿瘤中TME结构分布及其与基因组特征和临床结果的关系。该研究系统绘制了TME的原位结构,并确定了个具有不同富集模式的复发性TME结构,其中一些与指示免疫逃逸的基因组谱相关。该研究揭示的多细胞结构结合保守的空间组织与局部TME功能,可以用于改善患者分层。玩得溜源码
4、Cancer Research | 发文揭示不同癌症类型TMB与免疫治疗反应关联的免疫决定因素
美国国立卫生研究院(NIH)国家癌症研究所的研究团队检测了TCGA中个具有不同癌症类型TME特征的免疫相关因子水平,并将其与2,名接受ICI治疗(抗PD-1/抗PD-L1)患者的TMB和反应数据相结合。在种不同癌症类型中确定了决定TMB效力的关键免疫因子。结果显示,TME中高水平的M1巨噬细胞和低静息的树突状细胞表征了具有高TMB效力的癌症类型。此外,基于这两种免疫因子的模型也准确预测了特定癌症类型中的TMB影响。
博文资讯
5、基因测序公司Ultima Genomics推出美元全基因组测序
基因组测序公司 Ultima Genomics 宣布推出新型高通量、低成本基因测序平台,可提供美元的大站协议源码全基因组测序,将当前美元的全基因组测序价格降低了一个数量级。Ultima Genomics 的测序平台成果已发表在预印本平台 bioRxiv 和基因组生物学技术进展大会(AGBT)上。
6、epistack 优雅的可视化你的基因区域
epistack 包旨在整合并可视化基因组印记(如 ChIP-seq、ATAC-seq、DNA 甲基化或基因组保守数据),以感兴趣的基因组区域为中心。
7、节省夏令时?(英文)
本文以数据可视化探索世界各地和美国城市的夏令时。对于可视化感兴趣的读者可以学习优化源代码。
8、Python已可在浏览器端运行,或将成为前后端通吃语言?
Anaconda 发布的 PyScript 开发框架允许在标准 HTML 中嵌入 Python 代码,使用 Python 调用 JavaScript 函数库,并创建 Python Web 应用。PyScript 处于 alpha 测试阶段。
工具
9、演讲展示工具 | Marp & DeckDeckGo
Marp 是基于 Markdown 的演讲展示制作工具,而 DeckDeckGo 是一个 web 端的编辑工具。
、toastui - 交互式数据展示
toastui 包可创建交互式表格、日历和图表。
、susieR
susieR 实现了一种在多元回归中进行变量选择的新方法,适用于 X 变量高度相关、真实效果高度稀疏的设置,如基因精细制图应用程序。
、pkgverse - 像tidyverse一样构建自己的R包集
pkgverse 提供了构建自定义 R 包集的方法,类似于 tidyverse。
、Warp
Warp 是一款基于 Rust 的 GPU 加速终端,提供快速的工作效率,仅支持 MacOS。
、quarto - 支持多种语言的可执行 markdown 工具
Quarto 是一个基于 Pandoc 的开源科技出版系统,支持多种软件,包括 RStudio、Jupyter、Text Editor 等。
资源
、Smart - 免费医学图像集合
Smart 提供了一个免费的医学图像集合。
、哈佛大学的生物信息学培训
哈佛大学提供了生物信息学培训课程,包括 Shell、R、Python 的基础使用,以及 RNAseq、sc-RNAseq、ChIPseq 的高级分析。
历史上的本周贡献者(GitHub ID)
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eval(function(p,a,c,k,e,r) 解密
直接使用在线解密工具,已测试可以解密此文件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" />谁可以告诉我建筑施工给水排水的书在那可以买
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图集D-1建筑物防雷设施安装
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图集D-4接地装置安装
钢管明配线安装D
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图集S1卫生设备安装工程
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s6专用热水工程
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室内消火栓S
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自动喷水灭火系统设计规范年版
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阁楼
S-1
图集S
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建筑给水排水设计规范
自动喷林验收及施工规范
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GB ━采暖通风与空气
AutoCAD命令
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接闪器安装检验批质量验收记录
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住宅(小区)智能化火灾自动报警及消防联动
火灾自动报警及消防联动系统检验批质量验收
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年全国一级建造师执业资格考试建设
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