软件部署第三弹-Lammps在linux系统部署安装
LAMMPS,源码即大型原子/分子大规模并行模拟器,源码是源码由美国Sandia国家实验室开发的一款经典分子动力学代码。它主要用于模拟气体、源码液体和固体状态下粒子的源码集合行为,能够处理全原子、源码网贷宣传源码聚合物、源码生物、源码金属、源码粒状和粗粒化体系。源码
本次文章旨在提供高效可用的源码安装部署方法,对使用Linux系统以及刚接触科学计算类软件的源码用户十分友好。LAMMPS是源码目前用于分子动力学模拟的常用软件之一,网上安装教程质量参差不齐。源码获取LAMMPS时,源码访问官网lammps.org。下载页面提供了历史版本,可通过github.com/lammps/lammp...获取。为了更加灵活地构建或扩展LAMMPS,建议下载源码,从源代码级别重新构建。
安装部署Intel oneAPI,具体可参考blog.csdn.net/u...。加载编译依赖环境后,解压安装。在该路径下有常用各类编译器配置的makefile文件,本次以intel+intelmpi为例。编译配置参考。
针对非intel平台优化和注意事项,修改Makefile.mpi内容:去掉-xHost -qopt-zmm-usage=high,添加-march=haswell。黄瓜视频源码-xHOST是Intel 编译器针对Intel处理器增加的编译优化选项,Intel 编译器内没有集成AMD处理器微架构相关信息。但AMD处理器所包含X扩展指令集特性与Intel Haswell架构处理器类似,因此可参考AMD手册选取适合参数来帮助Intel编译器识别AMD处理器上的指令集特性。
可选模块安装,例如electrode需要在lmmps/lib/electrode/下执行。生成对应的Makefile.lammps文件和对应的库文件libelectrode.a。VORONOI安装需要额外安装voro++-0.4.6,下载解压到lammps/lib/voronoi。修改lammps-xx/lib/voronoi/Makefile.lammps,在src目录下生成所需的可执行文件。可以查看已安装配置信息和已安装模块。
LAMMPS软件测试,解压目录下加载lammps环境。LAMMPS使用MKL库完成其中的数学运算,但该库会通过内部函数检测是否为Intel处理器,在Intel处理器上MKL库的加速效果更好。在AMD平台可以加载libisintel.so,把AMD识别成Intel,以更好发挥MKL数学库的计算能力。libisintel.so库具体可参考上期文章。命令行运行,查看运行结果示例,timesteps/s值为性能参数,值越大性能越好。参考引用。
oneDNN 如何运行在 Nvidia GPU 上
在探索如何利用oneDNN库在Nvidia GPU上进行深度神经网络运算时,需要首先了解其工作原理以及实现步骤。Nvidia GPU与Intel oneAPI的oneDNN库之间紧密协作,实现高效并行计算。以下步骤指导如何将oneDNN集成至Nvidia GPU系统中。源码吾爱破解
首先,确保安装最新版本的Nvidia驱动,比如T4驱动..与CUDA .2,或V驱动..与CUDA .4。驱动兼容性是确保GPU性能发挥的关键。
其次,构建CUDA设备编译器,参考官方文档完成编译工具链的搭建。这一过程确保了与Nvidia GPU的兼容性。
接下来,针对CUDA设备构建OneDNN库,通常需要配套的cudnn库支持。这一步骤旨在优化深度学习模型的性能。
验证oneDNN提供的矩阵乘积示例在Nvidia GPU上的执行情况,确保库的正确集成与运行。
进一步,通过DPC++/SYCL编写并验证矩阵乘积示例,展示其跨平台特性,不仅适用于Intel GPU,也能在Nvidia、AMD等不同GPU架构上运行。
深入分析oneDNN与cudnn的集成。oneDNN通过提供封装后的cudnn实现,简化了GPU计算流程。从源代码中可见,DPC++仅对cudnn进行了封装,未在性能层面提供显著提升。
DPC++与SYCL作为跨平台的异构计算框架,能够高效运行于多种GPU架构,如Nvidia GPU。ssc投注源码它们通过引入扩展C++功能,支持多种架构,简化了代码移植与维护。
在DPC++编译器中,代码被分为主机与设备部分,分别由主机编译器与设备编译器处理。设备编译器后端生成的机器码,如Nvidia NVCC中的PTX或Intel GPU中的SPIR-V,是GPU执行的基础。
综合来看,通过遵循上述步骤与分析,用户能够成功在Nvidia GPU上部署oneDNN,实现高效且跨平台的深度神经网络运算。
实战教学:用Semantic Kernel框架集成腾讯混元大模型应用
实战教学:利用Semantic Kernel框架集成腾讯混元大模型
当开发者希望将Semantic Kernel与国内的大模型如腾讯混元对接时,如何操作?本文将带你通过oneAPI实现这一目标。智用人工智能应用研究院的CTO张善友将亲授实战教程。
张善友,以云原生开发为专长,他借助Semantic Kernel的SDK,能够将大型语言模型与传统编程语言无缝融合。SK支持C#、Python和Java,其中C#版本已发布1.0,提供模板和链接、深度集成等特性,让应用程序更加智能。
在集成过程中,首先了解腾讯混元大模型的强大功能,如强大的中文处理和逻辑推理。接下来,盗版源码侵权通过one-API的开源项目,将SK与OpenAI connector结合,以支持腾讯混元。只需简单部署docker镜像,配置OpenAI连接器,即可实现模型访问。
在配置One-API系统时,需要添加渠道,选择腾讯混元模型,提供API密钥,并创建令牌。终端使用时,只需将OpenAI的API Key替换为自定义的令牌。注意,不同用户组支持多个模型,可指定特定渠道处理请求。
通过自定义HttpClient,将OpenAI Endpoint指向oneAPI,整合到C#项目中,创建内核并配置日志和模型支持。最终,通过SK的流式传输,实现实时聊天应用与大模型的交互。
综上所述,Semantic Kernel为国内大模型的集成提供了有力工具,无论是在桌面还是服务器开发中,都为人工智能的集成开辟了新路径。同时,确保数据隐私合规是至关重要的。在「腾讯云TVP」公众号回复「大模型」,获取完整源代码实例。
vasp.5.4.4.pl2+wannier.2.1.0编译
初学者对vasp.5.4.4.pl2+wannier.2.1.0的编译过程可能会感到有些复杂,但实际操作起来并不困难。下面是一个详细的指导过程,旨在帮助初学者顺利完成编译。
准备阶段:
1. 确保您已经下载并安装了vasp.5.4.4.pl2和wannier.2.1.0软件。同时,安装intel oneAPI编译器也是必要的。
操作步骤:
2. 打开终端,切换到vasp源码所在的目录。确保目录结构正确,vasp和wannier的源码都在各自的目录下。
3. 下载肖承诚博士提供的接口文件VASP2WAN_v2_fix和mlwf.patch。下载链接如下:github.com/Chengcheng-X... 或者使用wwm.lanzouq.com/iOWNw...。将mlwf.patch文件拷贝到vasp.5.4.4.pl2的根目录。
4. 更新并编译vasp源码。确保所有依赖包已经正确安装,然后运行“make”命令。这将编译并生成可执行文件。
5. 执行编译好的vasp程序。在编译完成后,通过运行make all命令,可确保所有相关的程序和库都已成功构建。
注意:此教程适用于vasp.5.4.4.pl2+wannier.2.1.0的编译。如需使用vasp.6.3.x + wannier-3.1.0版本,可参考相关文档或链接进行操作。
在完成上述步骤后,您将成功编译并运行vasp程序。如有任何问题或错误提示,请及时调整和修正,确保编译过程顺利进行。
VASP 5.4.4编译与安装
本文提供如何在Linux Debian系统上安装和编译VASP 5.4.4的指南,同时介绍如何使用免费的Intel® oneAPI Base Toolkit与Intel® oneAPI HPC Toolkit替代付费的Intel Parallel Studio XE。以下为详细步骤:
一、安装Intel的编译器与库
首先,使用免费的Intel® oneAPI Base Toolkit与Intel® oneAPI HPC Toolkit安装所需的依赖库和编译器。推荐使用这两个工具以获取免费且易于更新的软件资源。注意,下载链接和哈希验证需确保文件完整与可执行。执行验证命令后,修改下载文件权限并按照指引完成安装。安装完成后,确认安装目录结构正确,并通过setvars.sh文件加载环境变量至.bashrc中,以实现每次终端启动时环境自动加载。
二、编译环境配置
安装完毕后,配置环境变量。首先运行setvars.sh文件以加载环境变量。若未出现此文件,可选择手动添加路径至.bashrc文件中。接下来,编译libfftw3xf_intel.a文件,确保编译路径正确且文件生成。
三、编译VASP
开始编译VASP前,确保系统中已安装rsync命令。解压VASP 5.4.4源码包后,根据个人路径修改makefile.include文件。根据官方教程配置MKLROOT路径,检查是否正确,若不正确,手动添加至.bashrc文件。在文件中进行特定的配置修改,如添加编译对象、编译参数、链接库等。编译完成后,VASP可执行文件将被生成。
四、将VASP添加至系统路径
将生成的可执行文件添加至系统路径,推荐将文件放入/usr/bin目录下。在该目录下创建vasp文件夹,并将可执行文件复制至其中。同时,将路径添加至.bashrc文件以确保每次终端启动时自动加载。通过特定命令检查MKL与VASP是否成功链接。
五、测试VASP
使用提供的测试文件(包括INCAR、KPOINTS、POSCAR、POTCAR)测试VASP,确保系统能够正确执行计算,并生成所需的输出文件。检查OUTCAR文件以验证计算结果。
六、解决常见问题与注意事项
在编译过程中,注意Intel编译器与库版本的兼容性,避免使用过时的工具。配置环境变量时,可能会遇到缺少setvars.sh文件的情况,可选择重新安装或手动添加路径。安装rsync命令避免潜在的配置问题。在makefile.include文件中,正确配置INC参数以解决可能的编译错误。
总结,遵循以上步骤并注意细节,您将能够成功安装、编译并运行VASP 5.4.4。如有疑问,可通过在线搜索获取更多帮助。
Visual Studio中调试和编译FDS
在Visual Studio中,虽然VS Code也支持调试,但其配置过程较为复杂。相比之下,VS作为商业软件,提供了更为直观的用户界面。FDS的编译和调试工作主要依赖于xxx.sln(解决方案文件)和xxx.vfproj(Fortran项目文件)的配置。根据知乎用户@lhyyy的建议,我们可以进行简便的配置优化。
首先,为了构建环境,你需要配置Visual Studio加上Intel的OneAPI。从GitHub克隆项目后,你需要在Build文件夹下创建名为VSBuild的新文件夹。在这个文件夹里,创建FDS.sln和FDS.vfproj两个文件,并在文本编辑器中输入相应的配置信息。
打开FDS.sln和FDS.vfproj文件,进行必要的设置后保存。双击sln文件或通过VS打开它,会看到项目属性的调试选项,按照指示进行修改。
编译阶段,只需在VS中点击“生成”并选择“生成解决方案”,如果遇到Fortran环境问题,可能需要调整FDS.vfproj中的路径,或者参考相关链接。编译成功后,由于脚本问题,可能无法获取版本信息,需要通过Python或批处理脚本来解决,可能需要对源码进行微调。
FDS有四种编译配置:x平台下的Debug和Release模式,以及O1、O2、O3不同程度的优化,初学者可以参考这些信息来了解。
对于调试,可以在VSBuild文件夹下创建一个testcase文件夹,编写test.fds输入卡,然后选择Debug模式,点击启动即可进行调试。如果你在开发过程中有任何问题,欢迎加入FDS开发与应用的QQ群()进行讨论。
2024-11-23 07:28
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